RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 MEGF11A6BM72 1044 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 RXRBP28702 533 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.49□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PP55 124 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 DLGAP3O95886 979 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 SGO2Q562F6 1265 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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TRDN-204ENST00000542443 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.48□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 GRIK1P39086 918 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 A0A096LPE4 126 aa8.46□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PPZ6 126 aa8.46□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 NEFLP07196 543 aa8.46□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 DRD2P14416 443 aa8.46□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 GRIA4P48058 902 aa8.46□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 PCDH1Q08174 1060 aa8.46□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 CCNJLQ8IV13 435 aa8.46□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.46□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 WDR64B1ANS9 1081 aa8.45□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 USP11P51784 963 aa8.45□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 ORC1Q13415 861 aa8.45□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.45□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 PRR19A6NJB7 356 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 TIAF1O95411 115 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 MAPK8P45983 427 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 CSRNP1Q96S65 589 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 TCF12Q99081 682 aa8.44□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.44□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 MAOBP27338 520 aa8.42□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 GIPC2Q8TF65 315 aa8.42□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.41□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 NPHS2Q9NP85 383 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 ATG3Q9NT62 314 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 ADAMTS4O75173 837 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 CYP11A1P05108 521 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 FGD1P98174 961 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 POU4F3Q15319 338 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-204ENST00000542443 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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TRDN-204ENST00000542443 SPINK2P20155 84 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ATP2B2Q01814 1243 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 MCTP1Q6DN14 999 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRDN-204ENST00000542443 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 FBF1Q8TES7 1133 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ZNF428Q96B54 188 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 SETDB2Q96T68 719 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 RAD18Q9NS91 495 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 F13BP05160 661 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 ADH5P11766 374 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 IRAK1P51617 712 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-204ENST00000542443 DTX1Q86Y01 620 aa8.38□□□□□ -1.07
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