RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 USP17L8P0C7I0 530 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 PDE6AP16499 860 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 UBE3CQ15386 1083 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 RAI14Q9P0K7 980 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.96□□□□□ -0.01
LMO3-217ENST00000537757 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ADD2P35612 726 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 SCNN1DP51172 638 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 RILPL2Q969X0 211 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 FSD1Q9BTV5 496 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.95□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 GAKO14976 1311 aa14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 MAST3O60307 1309 aa14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 GSTO1P78417 241 aa14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 SLF2Q8IX21 1173 aa14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CHGBP05060 677 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 LDHCP07864 332 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CHMLP26374 656 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CRKP46108 304 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 PPP4CP60510 307 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 OGFOD1Q8N543 542 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 POTECB2RU33 542 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 F8W031 263 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 HIP1O00291 1037 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CYP7A1P22680 504 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 MICALL2Q8IY33 904 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 TEKT1Q969V4 418 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.92□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 SHTN1A0MZ66 631 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 H7C1D1 291 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 EPS15P42566 896 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 APPBP2Q92624 585 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 OSBP2Q969R2 916 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 PSME4Q14997 1843 aa14.91□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 SPDYE6P0CI01 402 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CFAP100Q494V2 611 aa14.9□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LMO3-217ENST00000537757 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 CDC45O75419 566 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 EGFRP00533 1210 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RHBDL3P58872 404 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 DLGAP5Q15398 846 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 CERS3Q8IU89 383 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 FAM227BQ96M60 508 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 HACL1Q9UJ83 578 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.89□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 A0A0D9SFI3 127 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 WNT10BO00744 389 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 BAG3O95817 575 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.88□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 M0R2C6 588 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 BTDP43251 543 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms