RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529957.5

GNPTG-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 5

Gene GNPTG, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-208	ENST00000529957	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	FGFR2	P21802	821 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	FKTN	O75072	461 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	TNFAIP1	Q13829	316 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-208	ENST00000529957	CACNB3	P54284	484 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	INHBE	P58166	350 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	HTT	P42858	3142 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	EYA2	O00167	538 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	PTPN18	Q99952	460 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	ELP3	Q9H9T3	547 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	TEKT1	Q969V4	418 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	KIF16B	Q96L93	1317 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-208	ENST00000529957	CENPF	P49454	3210 aa		27.58	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	CRHR2	Q13324	411 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	VGLL4	Q14135	290 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	TNNI2	P48788	182 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	CAP1	Q01518	475 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	MRI	Q9BWK5	157 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	SIL1	Q9H173	461 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	LPIN2	Q92539	896 aa		27.55	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	SLC5A1	P13866	664 aa		27.54	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.54	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		27.54	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	TRIM17	Q9Y577	477 aa		27.54	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.53	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		27.52	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		27.52	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.51	■■■□□ 2
GNPTG-208	ENST00000529957	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	MAST3	O60307	1309 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	CIAO1	O76071	339 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	FAM83A	Q86UY5	434 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	MEIS3	Q99687	375 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	PRDX5	P30044	214 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	CCL15	Q16663	113 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	PHKA1	P46020	1223 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	WRNIP1	Q96S55	665 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	BRCA2	P51587	3418 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	SLC34A2	O95436	690 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	ADORA1	P30542	326 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	GTF2A2	P52657	109 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-208	ENST00000529957	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.46	■■□□□ 1.99

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