RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 CRKP46108 304 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 TNNI2P48788 182 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 KAZALD1Q96I82 304 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 MAP3K9P80192 1104 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRU-210ENST00000527027 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 GCC1Q96CN9 775 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTPRU-210ENST00000527027 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRU-210ENST00000527027 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRU-210ENST00000527027 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 BRCA2P51587 3418 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 TLR2O60603 784 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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PTPRU-210ENST00000527027 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 MAST3O60307 1309 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRU-210ENST00000527027 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 BTBD19C9JJ37 291 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 IRF6O14896 467 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 KIF22Q14807 665 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 DCAF15Q66K64 600 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 KIF16BQ96L93 1317 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-210ENST00000527027 FGFR2P21802 821 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 PPIL2Q13356 520 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 USP44Q9H0E7 712 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 PTPRCP08575 1304 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 GNRH1P01148 92 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 PPATQ06203 517 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.19■□□□□ 0.82
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