RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

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Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 MRIQ9BWK5 157 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PRDX5P30044 214 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 EPHX2P34913 555 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 GSTO1P78417 241 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 GOLIM4O00461 696 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 PDE4AP27815 886 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K12Q12852 859 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 TEKT1Q969V4 418 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 F8W031 263 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 EPS15P42566 896 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 TICAM2Q86XR7 235 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 RAI14Q9P0K7 980 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 RRAGCQ9HB90 399 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 POTECB2RU33 542 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 LDHCP07864 332 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 MECOMQ03112 1051 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 CRKP46108 304 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 DLGAP5Q15398 846 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 GRIK5Q16478 980 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 EVI5LQ96CN4 794 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 CERS3Q8IU89 383 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 CNTROBQ8N137 903 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 FOCADQ5VW36 1801 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 GAKO14976 1311 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 MYO1BO43795 1136 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 CFAP100Q494V2 611 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 SPDYE6P0CI01 402 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 TTC22Q5TAA0 569 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 SHTN1A0MZ66 631 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRK-218ENST00000525459 WNT10BO00744 389 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 LDHDQ86WU2 507 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 FSD1Q9BTV5 496 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 BAG3O95817 575 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 PDE6AP16499 860 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 ADD2P35612 726 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 UBE3CQ15386 1083 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF384Q8TF68 577 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 KIF3CO14782 793 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 PLCG2P16885 1265 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 EGFRP00533 1210 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 CYP7A1P22680 504 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-218ENST00000525459 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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