RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
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TSNARE1-208ENST00000524325 CYP7A1P22680 504 aa27.46■■□□□ 1.99
TSNARE1-208ENST00000524325 C8orf34Q49A92 452 aa27.46■■□□□ 1.99
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TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.46■■□□□ 1.99
TSNARE1-208ENST00000524325 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
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TSNARE1-208ENST00000524325 OSBP2Q969R2 916 aa27.46■■□□□ 1.99
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TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.43■■□□□ 1.98
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TSNARE1-208ENST00000524325 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.42■■□□□ 1.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SBF1O95248 1867 aa27.41■■□□□ 1.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC24BO95487 1268 aa27.41■■□□□ 1.98
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE3CQ15386 1083 aa27.41■■□□□ 1.98
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TSNARE1-208ENST00000524325 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.39■■□□□ 1.98
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TSNARE1-208ENST00000524325 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa27.39■■□□□ 1.98
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TSNARE1-208ENST00000524325 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 ARMT1Q9H993 441 aa27.39■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 CRKP46108 304 aa27.38■■□□□ 1.97
TSNARE1-208ENST00000524325 CASC1Q6TDU7 716 aa27.38■■□□□ 1.97
TSNARE1-208ENST00000524325 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.38■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 OGFOD1Q8N543 542 aa27.35■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.33■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 RPS12P25398 132 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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TSNARE1-208ENST00000524325 AK9Q5TCS8 1911 aa27.32■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.32■■□□□ 1.96
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TSNARE1-208ENST00000524325 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 BACH2Q9BYV9 841 aa27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 SLF2Q8IX21 1173 aa27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 MYOZ2Q9NPC6 264 aa27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.3■■□□□ 1.96
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