RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.97■■□□□ 1.11
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TSNARE1-207ENST00000521825 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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TSNARE1-207ENST00000521825 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.97■■□□□ 1.11
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TSNARE1-207ENST00000521825 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
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TSNARE1-207ENST00000521825 SEMA3EO15041 775 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC10A3P09131 477 aa21.95■■□□□ 1.1
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TSNARE1-207ENST00000521825 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.94■■□□□ 1.1
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TSNARE1-207ENST00000521825 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-207ENST00000521825 FZD1Q9UP38 647 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-207ENST00000521825 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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TSNARE1-207ENST00000521825 LBX1P52954 281 aa21.9■■□□□ 1.1
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TSNARE1-207ENST00000521825 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.87■■□□□ 1.09
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TSNARE1-207ENST00000521825 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.85■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 PI16Q6UXB8 463 aa21.85■■□□□ 1.09
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TSNARE1-207ENST00000521825 PDE3AQ14432 1141 aa21.84■■□□□ 1.09
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TSNARE1-207ENST00000521825 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 FAM83AQ86UY5 434 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 SPATA5Q8NB90 893 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 UNCXA6NJT0 531 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 MCAMP43121 646 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-207ENST00000521825 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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