RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 JAG2Q9Y219 1238 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CENPFP49454 3210 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRM8O00222 908 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CETPP11597 493 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRKP46108 304 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRMT2P55345 433 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VGLL4Q14135 290 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BEND3Q5T5X7 828 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRI3BPQ8WY22 251 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OTUD5Q96G74 571 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A1B0GUL6 1792 aa11.71□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TEPSINQ96N21 525 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OTOFQ9HC10 1997 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAST3O60307 1309 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AOX1Q06278 1338 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TLR2O60603 784 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VAMP4O75379 141 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ALDH1L1O75891 902 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GYG1P46976 350 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNAPC2Q13487 334 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF15Q66K64 600 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERO1BQ86YB8 467 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR63Q8IWG1 891 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TEKT1Q969V4 418 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 F6X3S4 739 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HOXD10P28358 340 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM83AQ86UY5 434 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WRNIP1Q96S55 665 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPIL2Q13356 520 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRIQ9BWK5 157 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 METTL24Q5JXM2 366 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BTBD19C9JJ37 291 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IRF6O14896 467 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAP1Q01518 475 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPATQ06203 517 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAET1EQ8TD07 263 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 H0YGN5 161 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PSMC4P43686 418 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DPF3Q92784 378 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUCLG2Q96I99 432 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM47Q96LD4 638 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SRRDQ9UH36 339 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF16BQ96L93 1317 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRCA2P51587 3418 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDE8BO95263 885 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAPN2P17655 700 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRK4P32298 578 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CACNB3P54284 484 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBXN2AP68543 259 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C17orf99Q6UX52 265 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms