RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.31■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 SPDYE6P0CI01 402 aa22.31■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 CRKP46108 304 aa22.31■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.3■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 GRIK5Q16478 980 aa22.3■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.3■■□□□ 1.16
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C1orf109-212ENST00000498448 SLF2Q8IX21 1173 aa22.3■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.3■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 ABCF2Q9UG63 623 aa22.3■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 IGSF3O75054 1194 aa22.29■■□□□ 1.16
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C1orf109-212ENST00000498448 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 CREBZFQ9NS37 354 aa22.29■■□□□ 1.16
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C1orf109-212ENST00000498448 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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C1orf109-212ENST00000498448 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.28■■□□□ 1.16
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C1orf109-212ENST00000498448 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
C1orf109-212ENST00000498448 ADM5C9JUS6 153 aa22.26■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 GCC1Q96CN9 775 aa22.26■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 BCL11AQ9H165 835 aa22.26■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.25■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 LDHCP07864 332 aa22.24■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.24■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 PI16Q6UXB8 463 aa22.24■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.24■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 RAI14Q9P0K7 980 aa22.24■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 CLRN2A0PK11 232 aa22.23■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 TNNI2P48788 182 aa22.23■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 CDCA5Q96FF9 252 aa22.23■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.22■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.22■■□□□ 1.15
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C1orf109-212ENST00000498448 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.21■■□□□ 1.15
C1orf109-212ENST00000498448 ATP5JP18859 108 aa22.2■■□□□ 1.14
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C1orf109-212ENST00000498448 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.2■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 FKBP1BP68106 108 aa22.19■■□□□ 1.14
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C1orf109-212ENST00000498448 RASA3Q14644 834 aa22.18■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.18■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.18■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 DLK2Q6UY11 383 aa22.18■■□□□ 1.14
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C1orf109-212ENST00000498448 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.17■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 MAP3K12Q12852 859 aa22.17■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.17■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.16■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.16■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 FAM83AQ86UY5 434 aa22.16■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 RASSF10A6NK89 507 aa22.15■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 BAG3O95817 575 aa22.15■■□□□ 1.14
C1orf109-212ENST00000498448 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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