RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491398.5

RABL3-208, Transcript of RAB, member of RAS oncogene family like 3, human

TSL 3

Gene RABL3, Length 1,007 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABL3-208	ENST00000491398		A0A1B0GUL7	405 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	ADORA1	P30542	326 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	PHKA1	P46020	1223 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	TIMM10	P62072	90 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	NOG	Q13253	232 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	VEZT	Q9HBM0	779 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	MAST3	O60307	1309 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	SEMA3E	O15041	775 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	ZBTB22	O15209	634 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	SSH3	Q8TE77	659 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	TEKT1	Q969V4	418 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	CCDC102A	Q96A19	550 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	MRI	Q9BWK5	157 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	TNFAIP1	Q13829	316 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	MOB2	Q70IA6	237 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	XAGE2	Q96GT9	111 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RABL3-208	ENST00000491398	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	SLC10A3	P09131	477 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ZIC5	Q96T25	663 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	RASGRF1	Q13972	1273 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	RASA3	Q14644	834 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	CEP85	Q6P2H3	762 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	PRDX5	P30044	214 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	PRKG1	Q13976	671 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	GPR108	Q9NPR9	543 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	COG6	Q9Y2V7	657 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	TNNI2	P48788	182 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	LBX1	P52954	281 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	GORAB	Q5T7V8	394 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	CA12	O43570	354 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	MAP3K11	Q16584	847 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	TNNI3K	Q59H18	835 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	FZD1	Q9UP38	647 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	CACNB3	P54284	484 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	PDE3A	Q14432	1141 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	TEPSIN	Q96N21	525 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	ABCF2	Q9UG63	623 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RABL3-208	ENST00000491398	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	FAM83A	Q86UY5	434 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	SPATA5	Q8NB90	893 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	CSRNP1	Q96S65	589 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	UNCX	A6NJT0	531 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RABL3-208	ENST00000491398	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07

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