RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 BCAR3O75815 825 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM27P14373 513 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 TM4SF4P48230 202 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 MCOLN1Q9GZU1 580 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 CDAN1Q8IWY9 1227 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 TEPSINQ96N21 525 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 COPRSQ9NQ92 184 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 SLC5A1P13866 664 aa34.71■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 SPRYD7Q5W111 196 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 CLMNQ96JQ2 1002 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXB3-211ENST00000490677 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 USP2O75604 605 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 MRIQ9BWK5 157 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 MTX1Q13505 466 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 HDAC5Q9UQL6 1122 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 IL15P40933 162 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 TNFAIP1Q13829 316 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 ATP2B3Q16720 1220 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 ZDHHC15Q96MV8 337 aa34.67■■■■□ 3.14
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HOXB3-211ENST00000490677 DGKZQ13574 1117 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 TEKT1Q969V4 418 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 CEP126Q9P2H0 1117 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 MYH2Q9UKX2 1941 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 GNAI3P08754 354 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 TCP10L2B9ZVM9 353 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 WNK4Q96J92 1243 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM39BQ9GZU3 492 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB22O15209 634 aa34.63■■■■□ 3.13
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC10A4Q96EP9 437 aa34.63■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 GJA5P36382 358 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 HHIPL2Q6UWX4 724 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 WDR66Q8TBY9 1149 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 CFHR5Q9BXR6 569 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 MAST3O60307 1309 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 TBC1D8O95759 1140 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 ADORA1P30542 326 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 PHKA1P46020 1223 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 CACNB3P54284 484 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 SREBF2Q12772 1141 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 SRGAP3O43295 1099 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 IREB2P48200 963 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 CLUAP1Q96AJ1 413 aa34.59■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
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HOXB3-211ENST00000490677 SALL1Q9NSC2 1324 aa34.57■■■■□ 3.13
HOXB3-211ENST00000490677 PRDX5P30044 214 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP1CQ5VVH2 108 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 AK9Q5TCS8 1911 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC85CA6NKD9 419 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 TNNI2P48788 182 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM57Q8N5G2 664 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 TIMM10P62072 90 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC102BQ68D86 513 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 FAM83AQ86UY5 434 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 SEMA3EO15041 775 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 DIXDC1Q155Q3 683 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 IFNL1Q8IU54 200 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 GPR25O00155 361 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 GNAI2P04899 355 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 INHBEP58166 350 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 TFCP2Q12800 502 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 DENND2AQ9ULE3 1009 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GUL7 405 aa34.51■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 ELP3Q9H9T3 547 aa34.51■■■■□ 3.12
HOXB3-211ENST00000490677 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 RGS19P49795 217 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 RASGRF1Q13972 1273 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 VGLL4Q14135 290 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 DOCK2Q92608 1830 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
HOXB3-211ENST00000490677 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.5■■■■□ 3.11
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