RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 ALDH1L1O75891 902 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 CAP1Q01518 475 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 SP3Q02447 781 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 SUCLG2Q96I99 432 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TEPSINQ96N21 525 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.46■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 CRKP46108 304 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 KAZALD1Q96I82 304 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.45■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 GRIK5Q16478 980 aa21.44■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.44■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 TNNI2P48788 182 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 BRCA2P51587 3418 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K9P80192 1104 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 VGLL4Q14135 290 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 VPS37DQ86XT2 251 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 CCL15Q16663 113 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 ARMC5Q96C12 935 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 GCC1Q96CN9 775 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 GTF2A2P52657 109 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 CACNB3P54284 484 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 LRRC24Q50LG9 513 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 OTUD5Q96G74 571 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 CSADQ9Y600 493 aa21.4■■□□□ 1.02
TOP3B-217ENST00000489581 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.39■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ANP32CO43423 234 aa21.38■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.38■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 METTL24Q5JXM2 366 aa21.38■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 UTYO14607 1347 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 TEKT1Q969V4 418 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.37■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 AK9Q5TCS8 1911 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 BCAMP50895 628 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGEF6Q15052 776 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF333Q96JL9 665 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 WRNIP1Q96S55 665 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 PDE8BO95263 885 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF11Q86T75 865 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ERO1BQ86YB8 467 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.33■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 CEP290O15078 2479 aa21.33■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 CETPP11597 493 aa21.33■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.33■■□□□ 1.01
TOP3B-217ENST00000489581 BTBD19C9JJ37 291 aa21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 IRF6O14896 467 aa21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 FAM83AQ86UY5 434 aa21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 MRIQ9BWK5 157 aa21.32■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 TLR2O60603 784 aa21.31■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.31■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 MAST3O60307 1309 aa21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 SNAPC2Q13487 334 aa21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 KIF22Q14807 665 aa21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 HOOK2Q96ED9 719 aa21.3■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 FGFR2P21802 821 aa21.29■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 PPIL2Q13356 520 aa21.29■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TOP3B-217ENST00000489581 DCAF15Q66K64 600 aa21.29■■□□□ 1
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