RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRM1	Q13255	1194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCAM	P43121	646 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNB3	P54284	484 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEMA3E	O15041	775 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	AOC2	O75106	756 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	MMP14	P50281	582 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	HUNK	P57058	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB22	O15209	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.71	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAST3	O60307	1309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	APBB1	O00213	710 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKG1	Q13976	671 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYH7	P12883	1935 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCNT	O95613	3336 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO1B	O43795	1136 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASA3	Q14644	834 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	AACS	Q86V21	672 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAK	O14976	1311 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC10A3	P09131	477 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXN1	O15353	648 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMMR	O75330	724 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZAP70	P43403	619 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	MECOM	Q03112	1051 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFIA	Q12857	509 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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