RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 VPS37DQ86XT2 251 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRF-211ENST00000467464 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRF-211ENST00000467464 SIL1Q9H173 461 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRF-211ENST00000467464 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 BCAR3O75815 825 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 MTX1Q13505 466 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 COPRSQ9NQ92 184 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 SLC5A1P13866 664 aa14.94□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 DGKZQ13574 1117 aa14.94□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.94□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB22O15209 634 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 TNFAIP1Q13829 316 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 ATP2B3Q16720 1220 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.93□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 PRDX5P30044 214 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 ADORA1P30542 326 aa14.91□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 CACNB3P54284 484 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 SREBF2Q12772 1141 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRF-211ENST00000467464 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.9□□□□□ -0.02
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PTPRF-211ENST00000467464 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.89□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.89□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.88□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.88□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 IFNL1Q8IU54 200 aa14.88□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 VGLL4Q14135 290 aa14.87□□□□□ -0.03
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PTPRF-211ENST00000467464 INHBEP58166 350 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 OPTNQ96CV9 577 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ELP3Q9H9T3 547 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 HTTP42858 3142 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1B0GUL7 405 aa14.85□□□□□ -0.03
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