RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465957.1

HPS1-207, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 922 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-207ENST00000465957 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS1-207ENST00000465957 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS1-207ENST00000465957 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS1-207ENST00000465957 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HPS1-207ENST00000465957 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 RASA3Q14644 834 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CRKP46108 304 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 DGKZQ13574 1117 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 LPIN2Q92539 896 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 SLC5A1P13866 664 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 RNF39Q9H2S5 420 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CIAO1O76071 339 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 TBC1D8O95759 1140 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 TM4SF4P48230 202 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 MAP3K11Q16584 847 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 SPRYD7Q5W111 196 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 PANK1Q8TE04 598 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 ATP2B3Q16720 1220 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 FBXO3Q9UK99 471 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-207ENST00000465957 CACNB3P54284 484 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 TEKT1Q969V4 418 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 TEPSINQ96N21 525 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 COPRSQ9NQ92 184 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 TNFAIP1Q13829 316 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 GNAI3P08754 354 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 SRGAP3O43295 1099 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 ADORA1P30542 326 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 SREBF2Q12772 1141 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 WNK4Q96J92 1243 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 MRIQ9BWK5 157 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 PHKA1P46020 1223 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 TNNI2P48788 182 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 GJA5P36382 358 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 TIMM10P62072 90 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 ELP3Q9H9T3 547 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HPS1-207ENST00000465957 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 UNCXA6NJT0 531 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 TFCP2Q12800 502 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 MTX1Q13505 466 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 MAST3O60307 1309 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 GNAI2P04899 355 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 PRDX5P30044 214 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 CCDC102BQ68D86 513 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 GPR25O00155 361 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 INHBEP58166 350 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 IFNL1Q8IU54 200 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 COG6Q9Y2V7 657 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-207ENST00000465957 A0A1B0GUL7 405 aa20.17■□□□□ 0.82
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