RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRIQ9BWK5 157 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 JAG2Q9Y219 1238 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM17Q9Y577 477 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF521Q96K83 1311 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRKP46108 304 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNNI2P48788 182 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRHR2Q13324 411 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MS4A4AQ96JQ5 239 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPN18Q99952 460 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIF16BQ96L93 1317 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VGLL2Q8N8G2 317 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPN22Q9Y2R2 807 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPRCP08575 1304 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PDE8BO95263 885 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP3K9P80192 1104 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SP3Q02447 781 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FKBP1CQ5VVH2 108 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARMC5Q96C12 935 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OPTNQ96CV9 577 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GTF2A2P52657 109 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM83AQ86UY5 434 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VPS37DQ86XT2 251 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZDHHC15Q96MV8 337 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM39BQ9GZU3 492 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ELP3Q9H9T3 547 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EFCC1Q9HA90 598 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCP10L2B9ZVM9 353 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VGLL4Q14135 290 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGEF6Q15052 776 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRIK5Q16478 980 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRC24Q50LG9 513 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 METTL24Q5JXM2 366 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BRI3BPQ8WY22 251 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TEKT1Q969V4 418 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOOK2Q96ED9 719 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CSADQ9Y600 493 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AK9Q5TCS8 1911 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAST3O60307 1309 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FGFR2P21802 821 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HHIPL2Q6UWX4 724 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GCC1Q96CN9 775 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP44Q9H0E7 712 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCL15Q16663 113 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ERO1BQ86YB8 467 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CEP290O15078 2479 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POTEFA5A3E0 1075 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB22O15209 634 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CETPP11597 493 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BCAMP50895 628 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAP1Q01518 475 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OTUD5Q96G74 571 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FBXO3Q9UK99 471 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 E9PSI1 815 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EYA2O00167 538 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPIL2Q13356 520 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DCAF15Q66K64 600 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM43AQ8N2R8 423 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LPIN2Q92539 896 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF333Q96JL9 665 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYH2Q9UKX2 1941 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TLR2O60603 784 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GNRH1P01148 92 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SNAPC2Q13487 334 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms