RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444220.2

AP000347.1-208, humanhuman

TSL 4

Gene AP000347.1, Length 618 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000347.1-208ENST00000444220 CA12O43570 354 aa28.34■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 CRKP46108 304 aa28.34■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 PRKG1Q13976 671 aa28.34■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.34■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 LAMB1P07942 1786 aa28.33■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.33■■■□□ 2.13
AP000347.1-208ENST00000444220 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 GNAI2P04899 355 aa28.31■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 CSRNP1Q96S65 589 aa28.31■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 RASA3Q14644 834 aa28.3■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.3■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.29■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 ADORA1P30542 326 aa28.29■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.29■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.28■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 RLBP1P12271 317 aa28.28■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 PHKA1P46020 1223 aa28.28■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.28■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 MAP3K11Q16584 847 aa28.27■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.27■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 TEKT1Q969V4 418 aa28.27■■■□□ 2.12
AP000347.1-208ENST00000444220 CAPN15O75808 1086 aa28.26■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TFCP2Q12800 502 aa28.26■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.26■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 RNF186Q9NXI6 227 aa28.26■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.26■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 MAST3O60307 1309 aa28.25■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TIMM10P62072 90 aa28.25■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TNFAIP1Q13829 316 aa28.25■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.25■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TEPSINQ96N21 525 aa28.25■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 MRIQ9BWK5 157 aa28.25■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.24■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.24■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 CCDC102BQ68D86 513 aa28.24■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 A0A1B0GUL7 405 aa28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TRPA1O75762 1119 aa28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 PRDX5P30044 214 aa28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 CACNB3P54284 484 aa28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 ZBTB22O15209 634 aa28.22■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.22■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.22■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.22■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 SEMA3EO15041 775 aa28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 AK9Q5TCS8 1911 aa28.21■■■□□ 2.11
AP000347.1-208ENST00000444220 POLA2Q14181 598 aa28.2■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.2■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 XAGE2Q96GT9 111 aa28.2■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.2■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 RASGRF1Q13972 1273 aa28.19■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 SPRYD7Q5W111 196 aa28.19■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 TNNI2P48788 182 aa28.18■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.18■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 TM4SF4P48230 202 aa28.17■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 ATP8B2P98198 1209 aa28.17■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 SSH3Q8TE77 659 aa28.17■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 PANK1Q8TE04 598 aa28.16■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.16■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 UNCXA6NJT0 531 aa28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 WNK4Q96J92 1243 aa28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 FAM83AQ86UY5 434 aa28.14■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.14■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 ABHD8Q96I13 439 aa28.14■■■□□ 2.1
AP000347.1-208ENST00000444220 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 GJA5P36382 358 aa28.13■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 DOCK2Q92608 1830 aa28.13■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 SREBF2Q12772 1141 aa28.12■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.12■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 PI16Q6UXB8 463 aa28.11■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
AP000347.1-208ENST00000444220 TBC1D8O95759 1140 aa28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms