RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PPFIA1Q13136 1202 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 OLFM4Q6UX06 510 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 AHCYL1O43865 530 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HOOK2Q96ED9 719 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCT7Q99832 543 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SCINQ9Y6U3 715 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAM200BP0CF97 657 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CEP78Q5JTW2 689 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP13Q86W25 1043 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 OPTNQ96CV9 577 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CENPKQ9BS16 269 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EMC3Q9P0I2 261 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PYGLP06737 847 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PIP4K2BP78356 416 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 STMN2Q93045 179 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 POTEFA5A3E0 1075 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAPQ12884 760 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KCNB1Q14721 858 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TEKT4Q8WW24 435 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 VCPKMTQ9H867 229 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 THEGQ9P2T0 379 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CDC45O75419 566 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1E1P36543 226 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GUCY2FP51841 1108 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 STXBP3O00186 592 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 POTEIP0CG38 1075 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 S100A1P23297 94 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 USP4Q13107 963 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SNX1Q13596 522 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF14Q5TI25 921 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 HIC2Q96JB3 615 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SGSM2O43147 1006 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF165P49910 485 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 KRT85P78386 507 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TTC30AQ86WT1 665 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ST7Q9NRC1 585 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 OPHN1O60890 802 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PDE1BQ01064 536 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CETN1Q12798 172 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SMC5Q8IY18 1101 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TAF4BQ92750 862 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.27□□□□□ -1.41
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