RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, human

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2L-209	ENST00000437652	INHBE	P58166	350 aa		32.64	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
UBAP2L-209	ENST00000437652	SLC5A1	P13866	664 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	TNNI2	P48788	182 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	GRIK5	Q16478	980 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		32.63	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	LPIN2	Q92539	896 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	TEKT1	Q969V4	418 aa		32.62	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	WNK4	Q96J92	1243 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	MRI	Q9BWK5	157 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	FBXO3	Q9UK99	471 aa		32.61	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	ALDH1A1	P00352	501 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	RGS19	P49795	217 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	SIL1	Q9H173	461 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		32.6	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	GPR25	O00155	361 aa		32.59	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.58	■■■□□ 2.81
UBAP2L-209	ENST00000437652	MAST3	O60307	1309 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	CIAO1	O76071	339 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.57	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	IFNL1	Q8IU54	200 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		32.56	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	TEPSIN	Q96N21	525 aa		32.55	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.54	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	FKTN	O75072	461 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		32.53	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	CACNB3	P54284	484 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	MEIS3	Q99687	375 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	ELP3	Q9H9T3	547 aa		32.52	■■■□□ 2.8
UBAP2L-209	ENST00000437652	GNAI3	P08754	354 aa		32.51	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	MAP3K9	P80192	1104 aa		32.51	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.51	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		32.5	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	GJA5	P36382	358 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.49	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	FAM83A	Q86UY5	434 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	OPTN	Q96CV9	577 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	HOOK2	Q96ED9	719 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	CSAD	Q9Y600	493 aa		32.48	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	32.47	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		32.47	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		32.46	■■■□□ 2.79
UBAP2L-209	ENST00000437652	SEMA3E	O15041	775 aa		32.44	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.44	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	32.44	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	PHKA1	P46020	1223 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	SOX10	P56693	466 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	VGLL4	Q14135	290 aa		32.43	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	BCAR3	O75815	825 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	TIMM10	P62072	90 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	PTPN18	Q99952	460 aa		32.42	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	PRDX5	P30044	214 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	GTF2A2	P52657	109 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	DCAF15	Q66K64	600 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	OTOF	Q9HC10	1997 aa		32.41	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	TRIM27	P14373	513 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	LAMB1	P07942	1786 aa		32.4	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	ADORA1	P30542	326 aa		32.39	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	CRHR2	Q13324	411 aa		32.39	■■■□□ 2.78
UBAP2L-209	ENST00000437652	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		32.39	■■■□□ 2.78

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