RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421827.2

UBXN11-208, Transcript of UBX domain protein 11, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN11, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11-208ENST00000421827 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 ADORA1P30542 326 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 TEKT1Q969V4 418 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 MAST3O60307 1309 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 PHKA1P46020 1223 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 LBX1P52954 281 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 TIMM10P62072 90 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 ATP8B2P98198 1209 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 IFFO2Q5TF58 517 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 MRIQ9BWK5 157 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 A0A1B0GUL7 405 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 SEMA3EO15041 775 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 TNFAIP1Q13829 316 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 POLA2Q14181 598 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 CCDC102BQ68D86 513 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 PANK1Q8TE04 598 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 ZBTB22O15209 634 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 CA12O43570 354 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 MS4A1P11836 297 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 PRKG1Q13976 671 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 RASA3Q14644 834 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 SSH3Q8TE77 659 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 TNS4Q8IZW8 715 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 XAGE2Q96GT9 111 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN11-208ENST00000421827 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 PRDX5P30044 214 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 TNNI2P48788 182 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 RASGRF1Q13972 1273 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 MAP3K11Q16584 847 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 TSKSQ9UJT2 592 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 FZD1Q9UP38 647 aa22.3■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 GORABQ5T7V8 394 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 CSRNP1Q96S65 589 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 CACNB3P54284 484 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 CEP85Q6P2H3 762 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 TEPSINQ96N21 525 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 GPR108Q9NPR9 543 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN11-208ENST00000421827 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 UNCXA6NJT0 531 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 FAM83AQ86UY5 434 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 TNNI3KQ59H18 835 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 RNF186Q9NXI6 227 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 ABCF2Q9UG63 623 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 COG6Q9Y2V7 657 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 TRPA1O75762 1119 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 SPRYD7Q5W111 196 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 SPATA5Q8NB90 893 aa22.22■■□□□ 1.15
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