RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 USP37Q86T82 979 aa24.3■■□□□ 1.48
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PTPRJ-201ENST00000418331 DYNC1I1O14576 645 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 FERMT2Q96AC1 680 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GVL5 298 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCN1P35523 988 aa24.29■■□□□ 1.48
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PTPRJ-201ENST00000418331 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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PTPRJ-201ENST00000418331 UFL1O94874 794 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCC4O15439 1325 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.28■■□□□ 1.48
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PTPRJ-201ENST00000418331 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
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PTPRJ-201ENST00000418331 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 TACC1O75410 805 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT83P78385 493 aa24.22■■□□□ 1.47
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PTPRJ-201ENST00000418331 GGA1Q9UJY5 639 aa24.22■■□□□ 1.47
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PTPRJ-201ENST00000418331 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.21■■□□□ 1.47
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PTPRJ-201ENST00000418331 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 PHKG2P15735 406 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 ARID5AQ03989 594 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF5AQ12840 1032 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRJ-201ENST00000418331 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT86O43790 486 aa24.2■■□□□ 1.46
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