RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1B0GUL7 405 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP8B2P98198 1209 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 POLA2Q14181 598 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 TEKT1Q969V4 418 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC10A3P09131 477 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKG1Q13976 671 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC102BQ68D86 513 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 MAST3O60307 1309 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 SEMA3EO15041 775 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 MS4A1P11836 297 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 SSH3Q8TE77 659 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 XAGE2Q96GT9 111 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 LBX1P52954 281 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 TNFAIP1Q13829 316 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 RASA3Q14644 834 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD39-201ENST00000393537 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 MRIQ9BWK5 157 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 FZD1Q9UP38 647 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 PRDX5P30044 214 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 RASGRF1Q13972 1273 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 TSKSQ9UJT2 592 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB22O15209 634 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 CA12O43570 354 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 TNNI2P48788 182 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNB3P54284 484 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 GORABQ5T7V8 394 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 IFFO2Q5TF58 517 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP85Q6P2H3 762 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 TNS4Q8IZW8 715 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 COG6Q9Y2V7 657 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD39-201ENST00000393537 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K11Q16584 847 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 TEPSINQ96N21 525 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 CSRNP1Q96S65 589 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 TNNI3KQ59H18 835 aa24.93■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR108Q9NPR9 543 aa24.93■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCF2Q9UG63 623 aa24.93■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.93■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.92■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.91■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 PI16Q6UXB8 463 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM83AQ86UY5 434 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA5Q8NB90 893 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 OTOFQ9HC10 1997 aa24.9■■□□□ 1.58
ANKRD39-201ENST00000393537 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms