RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 TTC6Q86TZ1 520 aa18.39■□□□□ 0.53
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PTPRN2-201ENST00000389413 KRT40Q6A162 431 aa18.34■□□□□ 0.53
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PTPRN2-201ENST00000389413 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 ARMT1Q9H993 441 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 ASIC1P78348 528 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 MLKLQ8NB16 471 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 NLRP1Q9C000 1473 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 MCM7P33993 719 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 KRT83P78385 493 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRN2-201ENST00000389413 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.31■□□□□ 0.52
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