RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SOCS5O75159 536 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGLV1-40P01703 118 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CGB3P0DN86 165 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNHG28P0DPA3 235 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLDCP23378 1020 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FASP25445 335 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADRA1BP35368 520 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MLLT10P55197 1068 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTK2Q05397 1052 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C9orf50Q5SZB4 431 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FHL5Q5TD97 284 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LCN10Q6JVE6 187 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1QL2Q7Z5L3 287 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF329Q86UD4 541 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VSIG10LQ86VR7 867 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRIMA1Q86XR5 153 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYT8Q8NBV8 401 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EDARADDQ8WWZ3 215 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC01599Q8WXQ3 324 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DNASE2BQ8WZ79 361 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NABP2Q9BQ15 211 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EBF4Q9BQW3 602 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAGPAQ9UK23 515 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LHX6Q9UPM6 363 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NID2Q14112 1375 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BIRC6Q9NR09 4857 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1B0GUV1 79 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR2DS3K7RE56 304 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NTN1O95631 604 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYF6P23409 242 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DGKGP49619 791 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 APLP2Q06481 763 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TEFQ10587 303 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIR2DS3Q14952 304 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TBC1D9BQ66K14 1250 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCAF15Q66K64 600 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC155Q8N6L0 562 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FLCNQ8NFG4 579 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF778Q96MU6 729 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SAMD11Q96NU1 681 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIOX1Q9H6W3 641 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C12orf49Q9H741 205 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYLDQ9NQC7 956 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT82Q9NSB4 513 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRPS1Q9UHF7 1281 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATRNL1Q5VV63 1379 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WIPF3A6NGB9 483 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB42B2RXF5 422 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAMP2O60895 175 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLGP00747 810 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZCCHC18P0CG32 403 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CGB7P0DN87 165 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCT4P50991 539 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIF22Q14807 665 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNMB1Q16558 191 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF792Q3KQV3 632 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 METTL24Q5JXM2 366 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGFL4Q6B9Z1 124 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MPZL3Q6UWV2 235 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM135Q86UB9 458 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUTM1Q86Y26 1132 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FGFRL1Q8N441 504 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF485Q8NCK3 441 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNN1Q92952 543 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CYYR1Q96J86 154 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LMLNQ96KR4 655 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP-1.28□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms