RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GUL7 405 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY3P0CV98 308 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TSPY8P0CW00 308 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.573e-7■■■□□ 14.6
PTPRC-201ENST00000348564 TFCP2Q12800 502 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 IQCA1Q86XH1 822 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MROH5Q6ZUA9 1318 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RGPD1P0DJD0 1748 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CD209Q9NNX6 404 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CCL15Q16663 113 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NSMFQ6X4W1 530 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CHST3Q7LGC8 479 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SUCLG2Q96I99 432 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC4O15439 1325 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM29Q14134 588 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PNMA3Q9UL41 463 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF5O00463 557 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC6O95255 1503 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TTLL11Q8NHH1 800 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CUL5Q93034 780 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 XAGE2Q96GT9 111 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SLIT2O94813 1529 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ADM5C9JUS6 153 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SP4Q02446 784 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 DIXDC1Q155Q3 683 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 HOMER1Q86YM7 354 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MXD3Q9BW11 206 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 BTDP43251 543 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FOSBP53539 338 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RGMBQ6NW40 437 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FAM184AQ8NB25 1140 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC69A6NI79 296 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED4O75132 1171 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FLOT1O75955 427 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CRKP46108 304 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 LBX1P52954 281 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 HAND2P61296 217 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SPP2Q13103 211 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 AAMPQ13685 434 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD2Q14681 263 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC24Q50LG9 513 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 COL18A1P39060 1754 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PDE8BO95263 885 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH1A1P00352 501 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KCNH4Q9UQ05 1017 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CNPY2Q9Y2B0 182 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MCTP1Q6DN14 999 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 GINS2Q9Y248 185 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ATP10DQ9P241 1426 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 HIP1O00291 1037 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RAB11FIP3O75154 756 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CSPG5O95196 566 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K9P80192 1104 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FSTL1Q12841 308 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2B6P20813 491 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1178 ms