RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 H7C1D1 291 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 EPS15P42566 896 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MRIQ9BWK5 157 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 RRAGCQ9HB90 399 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ABCF2Q9UG63 623 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.12■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 F8W031 263 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 EPHX2P34913 555 aa16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.11■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.1■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MYOZ2Q9NPC6 264 aa16.1■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GOLIM4O00461 696 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC42-201ENST00000293845 EGFRP00533 1210 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CRKP46108 304 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MECOMQ03112 1051 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF384Q8TF68 577 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 TEKT1Q969V4 418 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 RAI14Q9P0K7 980 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 GAKO14976 1311 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 KIF3CO14782 793 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MAP3K12Q12852 859 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP100Q494V2 611 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SLF2Q8IX21 1173 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 WNT10BO00744 389 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SPDYE6P0CI01 402 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 GSTO1P78417 241 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 DLGAP5Q15398 846 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 FOCADQ5VW36 1801 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 LDHCP07864 332 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 TTC22Q5TAA0 569 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 EVI5LQ96CN4 794 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 PDE6AP16499 860 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ADD2P35612 726 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 LDHDQ86WU2 507 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 TICAM2Q86XR7 235 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 POTEIP0CG38 1075 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 POTEJP0CG39 1038 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 UBE3CQ15386 1083 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 SKAP1Q86WV1 359 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 CNTROBQ8N137 903 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC42-201ENST00000293845 MYO1BO43795 1136 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC42-201ENST00000293845 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCDC42-201ENST00000293845 CYP7A1P22680 504 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms