RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 LCORLQ8N3X6 602 aa18.55■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.55■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 CPLX1O14810 134 aa18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 ADCY5O95622 1261 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 TRDNQ13061 729 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 LUZP1Q86V48 1076 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 TNMDQ9H2S6 317 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 LAMA4Q16363 1823 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 FUCA2Q9BTY2 467 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 TAF1P21675 1872 aa18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 EVX2Q03828 476 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 TOM1O60784 492 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 SPC24Q8NBT2 197 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 NAPBQ9H115 298 aa18.52■□□□□ 0.56
SLC20A1-201ENST00000272542 GNPATO15228 680 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CDC27P30260 824 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 MAP3K12Q12852 859 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 UBE3CQ15386 1083 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ME1P48163 572 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 RAI14Q9P0K7 980 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.51■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 MAP3K11Q16584 847 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 PARP10Q53GL7 1025 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 C8orf76Q96K31 380 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CLIC4Q9Y696 253 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF28PB7ZC32 967 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 TDO2P48775 406 aa18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 NPHP1O15259 732 aa18.49■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 VPS37DQ86XT2 251 aa18.49■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 TYRO3Q06418 890 aa18.49■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.49■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 PRDM1O75626 825 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CYP7A1P22680 504 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 BARGINQ6ZT62 677 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ELP1O95163 1332 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1B0GVL5 298 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.48■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC192P0DO97 292 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP45Q9UL16 551 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC12Q96J65 1359 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 USP21Q9UK80 565 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 PHLPP1O60346 1717 aa18.47■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.46■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 APOA5Q6Q788 366 aa18.46■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLC20A1-201ENST00000272542 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms