RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAD50Q92878 1312 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNIP1Q15025 636 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL25Q9H293 177 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAI14Q9P0K7 980 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF2CQ99661 725 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DOCK2Q92608 1830 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHTN1A0MZ66 631 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BECN1Q14457 450 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF384Q8TF68 577 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GMLQ99445 158 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCCP23508 829 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCNN1DP51172 638 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MECOMQ03112 1051 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM227BQ96M60 508 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSME4Q14997 1843 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPC2Q8N158 579 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0D9SFI3 127 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K12Q12852 859 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE6AP16499 860 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L8P0C7I0 530 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANAPC15P60006 121 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RABEP1Q15276 862 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLTPD2A6NH11 291 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP7A1P22680 504 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADD2P35612 726 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSPA4P34932 840 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MICALL2Q8IY33 904 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNX21Q969T3 373 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DPF2Q92785 391 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17RAQ96F46 866 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPS15P42566 896 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRKP46108 304 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OGFOD1Q8N543 542 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EGFRP00533 1210 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A3P48751 1232 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTH1RQ03431 593 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSBP2Q969R2 916 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAST3O60307 1309 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE3CQ15386 1083 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP100Q494V2 611 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSCBQ8IWL3 235 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms