RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 ABCF2Q9UG63 623 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 MYH7P12883 1935 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 MAST3O60307 1309 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.65■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 ZAP70P43403 619 aa23.64■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.64■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.63■■□□□ 1.37
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HOXD11-201ENST00000249504 CNTROBQ8N137 903 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD11-201ENST00000249504 TEKT1Q969V4 418 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD11-201ENST00000249504 RAI14Q9P0K7 980 aa23.59■■□□□ 1.37
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HOXD11-201ENST00000249504 TOMM70O94826 608 aa23.59■■□□□ 1.37
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HOXD11-201ENST00000249504 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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HOXD11-201ENST00000249504 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXD11-201ENST00000249504 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.5■■□□□ 1.35
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