RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 GNAI2P04899 355 aa26.01■■□□□ 1.75
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CITED1-201ENST00000246139 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26■■□□□ 1.75
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CITED1-201ENST00000246139 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.99■■□□□ 1.75
CITED1-201ENST00000246139 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.99■■□□□ 1.75
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CITED1-201ENST00000246139 TEKT1Q969V4 418 aa25.92■■□□□ 1.74
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CITED1-201ENST00000246139 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 TBC1D8O95759 1140 aa25.9■■□□□ 1.74
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CITED1-201ENST00000246139 TFCP2Q12800 502 aa25.9■■□□□ 1.74
CITED1-201ENST00000246139 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.9■■□□□ 1.74
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CITED1-201ENST00000246139 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.89■■□□□ 1.74
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CITED1-201ENST00000246139 MAST3O60307 1309 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ADORA1P30542 326 aa25.88■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.88■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.88■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 CCDC102BQ68D86 513 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 CACNB3P54284 484 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K11Q16584 847 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.85■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 XAGE2Q96GT9 111 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED1-201ENST00000246139 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.83■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 SREBF2Q12772 1141 aa25.83■■□□□ 1.73
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CITED1-201ENST00000246139 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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CITED1-201ENST00000246139 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 HTTP42858 3142 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 UNCXA6NJT0 531 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 TEPSINQ96N21 525 aa25.81■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 GPR25O00155 361 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB22O15209 634 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 PRDX5P30044 214 aa25.8■■□□□ 1.72
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CITED1-201ENST00000246139 GORABQ5T7V8 394 aa25.8■■□□□ 1.72
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.8■■□□□ 1.72
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