RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 FZD1Q9UP38 647 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 LPIN2Q92539 896 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 BCAMP50895 628 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SPRYD7Q5W111 196 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 CFHR5Q9BXR6 569 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 TNNQ9UQP3 1299 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SRGAP3O43295 1099 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 FGFR2P21802 821 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 HTTP42858 3142 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 GNAI2P04899 355 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SPDYE6P0CI01 402 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 ATP2B3Q16720 1220 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 VEZTQ9HBM0 779 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 COPRSQ9NQ92 184 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-201ENST00000219479 CLRN2A0PK11 232 aa27.01■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.01■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 FKTNO75072 461 aa27■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 MAP3K11Q16584 847 aa27■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 AOX1Q06278 1338 aa26.99■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.99■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 OTOFQ9HC10 1997 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 MTX1Q13505 466 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 ALDH1A1P00352 501 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 WNK4Q96J92 1243 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 CRKP46108 304 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 TNFAIP1Q13829 316 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 IFNL1Q8IU54 200 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 MAST3O60307 1309 aa26.95■■□□□ 1.91
NME4-201ENST00000219479 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.95■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TEKT1Q969V4 418 aa26.95■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.95e-7■■■■■ 32
NME4-201ENST00000219479 INHBEP58166 350 aa26.94■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.94■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.94■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 GRIK5Q16478 980 aa26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 CENPFP49454 3210 aa26.93■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 UNCXA6NJT0 531 aa26.91■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TFCP2Q12800 502 aa26.91■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 RASA3Q14644 834 aa26.91■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.9■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 GJA5P36382 358 aa26.9■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TNNI2P48788 182 aa26.9■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.9■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.9■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 SEMA3EO15041 775 aa26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 ADORA1P30542 326 aa26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 PHKA1P46020 1223 aa26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TIMM10P62072 90 aa26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 TRIM17Q9Y577 477 aa26.89■■□□□ 1.9
NME4-201ENST00000219479 A0A1B0GUL7 405 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 RLBP1P12271 317 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 CCDC102BQ68D86 513 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 MRIQ9BWK5 157 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 MS4A1P11836 297 aa26.87■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
NME4-201ENST00000219479 GORABQ5T7V8 394 aa26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms