RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-222ENST00000630804 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 GGTLC3B5MD39 225 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SOX8P57073 446 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 IGKV3-20P01619 116 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 CRPP02741 224 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 CD1AP06126 327 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 C12orf73Q69YU5 71 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.16□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 XAF1Q6GPH4 301 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 CITED1Q99966 193 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 FGF11Q92914 225 aa7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 C9JCJ5 164 aa7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 C10orf35Q96D05 121 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 DPRXA6NFQ7 191 aa7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 LINC00596Q86U02 117 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-222ENST00000630804 MARVELD3Q96A59 401 aa7.15□□□□□ -1.26
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SPTAN1-222ENST00000630804 TDGF1P3P51864 188 aa7.15□□□□□ -1.27
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SPTAN1-222ENST00000630804 PATE4P0C8F1 98 aa7.14□□□□□ -1.27
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SPTAN1-222ENST00000630804 FXYD3Q14802 87 aa7.14□□□□□ -1.27
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SPTAN1-222ENST00000630804 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 CTSVO60911 334 aa7.14□□□□□ -1.27
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SPTAN1-222ENST00000630804 WDFY2Q96P53 400 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 ABHD1Q96SE0 405 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 ASB1Q9Y576 335 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 AGAP20933 346 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 LCN2P80188 198 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 SPINK14Q6IE38 97 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 SIGMAR1Q99720 223 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.14□□□□□ -1.27
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SPTAN1-222ENST00000630804 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 DRD3P35462 400 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 TMPRSS3P57727 454 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 WDR54Q9H977 334 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 CCL21O00585 134 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-222ENST00000630804 PLPP3O14495 311 aa7.14□□□□□ -1.27
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