RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	NGF	P01138	241 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	S100G	P29377	79 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PAX9	P55771	341 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	GABRA6	Q16445	453 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CYYR1	Q96J86	154 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		12.9	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		H0Y980	276 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	LYZL6	O75951	148 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	OR5G3	P0C626	314 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2G2	P60604	165 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	FOXF2	Q12947	444 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CST9LP1	Q5W188	147 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ASCL4	Q6XD76	172 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZWC4	215 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	DOCK7	Q96N67	2140 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		K7ENP7	123 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MLNR	O43193	412 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	TBR1	Q16650	682 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01551	Q86U37	167 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF525	Q8N782	197 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	RSG1	Q9BU20	258 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	IL36G	Q9NZH8	169 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0U1RQK1	487 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF320	A2RRD8	509 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CCL25	O15444	150 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	GLI4	P10075	376 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	COX5A	P20674	150 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	BMP5	P22003	454 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PROCR	Q9UNN8	238 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	SPTBN2	O15020	2390 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ANGPTL7	O43827	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	WDR1	O75083	606 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	NXPH2	O95156	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	KRAS	P01116	189 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	GCH1	P30793	250 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	GNRHR	P30968	328 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MSMO1	Q15800	293 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PR80	420 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PDCD6	O75340	191 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	WNT2	P09544	360 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	APC2	O95996	2303 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CD300LB	A8K4G0	201 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		J3QW42	95 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PDE6D	O43924	150 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CGA	P01215	116 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CELA3B	P08861	270 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CTXN2	P0C2S0	81 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CTRL	P40313	264 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659		Q0VG73	95 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS8	Q16651	343 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	COX11	Q9Y6N1	276 aa		12.86	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	GTF3C1	Q12789	2109 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	HOXC12	P31275	282 aa		12.85	□□□□□ -0.35
BBS1-225	ENST00000630659	TFPI2	P48307	235 aa		12.85	□□□□□ -0.35

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