RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 BPNT1O95861 308 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SRMP19623 302 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS2P43631 304 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT4P56705 351 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM177Q53S58 311 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 IDO2Q6ZQW0 420 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 OVOL2Q9BRP0 275 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SDHAF2Q9NX18 166 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TRDCB7Z8K6 153 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP5D1E7EU14 171 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 BET1O15155 118 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS8Q16651 343 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTL6BO94805 426 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 QRFPP83859 136 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF45Q02386 682 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RY14Q15391 338 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD9Q8NE22 299 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PHYHIPQ92561 330 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2J3O76001 311 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CD3GP09693 182 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 RRASP10301 218 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINB10P48595 397 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2KP61086 200 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX45Q8NA69 505 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6M1Q8NGM8 313 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNG8Q8WXS5 425 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A14Q9HCY8 104 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 FRAS1Q86XX4 4008 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YWU9 116 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 GGCTO75223 188 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 NECAP1Q8NC96 275 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 HSF4Q9ULV5 492 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2C1O95371 312 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYZL1O95825 349 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf32Q32M92 178 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 AHSA2Q719I0 299 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4A4PQ8NGN8 299 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SPIN2AQ99865 258 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PECRQ9BY49 303 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP7O15540 132 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM209BQ5JX69 171 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM61Q8N0U2 210 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10J5Q8NHC4 309 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf30Q96GV9 206 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB8O95169 186 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TPBGQ13641 420 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF11Q5DX21 431 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF320A2RRD8 509 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CBLN1P23435 193 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM50BP56557 158 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf55Q5SWW7 151 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS9O00182 355 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-23P01764 117 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD55Q3KP44 614 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 LYG2Q86SG7 212 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A42Q86VD7 318 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC9CQ8N5M4 171 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ADTRPQ96IZ2 230 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL7Q9UJT9 491 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL3P36405 182 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP2K4P45985 399 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 GINS4Q9BRT9 223 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 DPPA5A6NC42 116 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DEDDO75618 318 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB11BQ15907 218 aa20.45■□□□□ 0.86
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