RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA1	O95477	2261 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf63	A6NC05	138 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	VAMP3	Q15836	100 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53I3	Q53FA7	332 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM57B	Q71RH2	274 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NIT1	Q86X76	327 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM45B	Q96B21	275 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	HIVEP2	P31629	2446 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	H2BFM	P0C1H6	154 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	COX5A	P20674	150 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FCGR2C	P31995	323 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RIPPLY3	P57055	190 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A10	P60903	97 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PAFAH1B2	P68402	229 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PAX2	Q02962	417 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZP4	Q12836	540 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	POC1A	Q8NBT0	407 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NINJ1	Q92982	152 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM186	Q96B77	213 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	JKAMP	Q9P055	326 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		E7EQL1	145 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	GCH1	P30793	250 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	P2RY1	P47900	373 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	IL15RA	Q13261	267 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB32	Q13637	225 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2T27	Q8NH04	317 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RARRES2	Q99969	163 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	HIVEP1	P15822	2718 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		K7N7A8	449 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RND3	P61587	244 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ODF1	Q14990	250 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TDRG1	Q3Y452	100 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4A47	Q6IF82	309 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL17	Q92583	94 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD6	Q9BV23	337 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	GP6	Q9HCN6	339 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		H0Y8G0	127 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ARPC3	O15145	178 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR7C2	O60412	319 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PF4	P02776	101 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYGS	P22914	178 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CD1B	P29016	333 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM219A	Q8IW50	185 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PNKD	Q8N490	385 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NABP1	Q96AH0	204 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		G3V4G9	280 aa		6.09	□□□□□ -1.44
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R135	149 aa		6.09	□□□□□ -1.44
LETMD1-238	ENST00000623495	PSG1	P11464	419 aa		6.09	□□□□□ -1.44
LETMD1-238	ENST00000623495	MPV17	P39210	176 aa		6.09	□□□□□ -1.44
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRA2	P47869	451 aa		6.09	□□□□□ -1.44
LETMD1-238	ENST00000623495	TPPP2	P59282	170 aa		6.09	□□□□□ -1.44
LETMD1-238	ENST00000623495	ICAM4	Q14773	271 aa		6.09	□□□□□ -1.44

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