RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 Q8N7P7 452 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SLC35G3Q8N808 338 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 RNF141Q8WVD5 230 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 IL22RA2Q969J5 263 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 NSG2Q9Y328 171 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 CUBNO60494 3623 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 C17orf98A8MV24 154 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 H0Y980 276 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 AESQ08117 197 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 CORO2AQ92828 525 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TNFRSF14Q92956 283 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 KIRREL1Q96J84 757 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF714Q96N38 554 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.2□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 RAB19A4D1S5 217 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 NUDT19A8MXV4 375 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TEX46H3BTG2 121 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 ST8SIA3O43173 380 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 GPR137BO60478 399 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 UQCC3Q6UW78 93 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 STPG2Q8N412 459 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TMED6Q8WW62 240 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 MARC2Q969Z3 335 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 ARV1Q9H2C2 271 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 FBXL17Q9UF56 701 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 F2RP25116 425 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 GLIPR1P48060 266 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 TCF23Q7RTU1 214 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF695Q8IW36 515 aa7.19□□□□□ -1.26
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SMAD4-217ENST00000611848 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 COQ2Q96H96 371 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SMIM8Q96KF7 97 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 JMJD8Q96S16 334 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SPIN2AQ99865 258 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.19□□□□□ -1.26
SMAD4-217ENST00000611848 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.19□□□□□ -1.26
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