RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	METTL26	Q96S19	204 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	CAD	P27708	2225 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PLAU	P00749	431 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PRSS1	P07477	247 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	MFAP4	P55083	255 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PSG7	Q13046	419 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	GUCA2B	Q16661	112 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	C12orf57	Q99622	126 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	SCN5A	Q14524	2016 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151		H3BQ15	152 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	BMPR1B	O00238	502 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ADAM11	O75078	769 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	S1PR2	O95136	353 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	LHX2	P50458	406 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	CLDN18	P56856	261 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	HIST3H3	Q16695	136 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PPOX	P50336	477 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	RHBDL1	O75783	438 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	BCL2	P10415	239 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	MELTF	P08582	738 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	UCP3	P55916	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	HAX1	O00165	279 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	CCKAR	P32238	428 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ZG16	O60844	167 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	MGP	P08493	103 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF137P	P52743	207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	CXCL2	P19875	107 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	SULT1A2	P50226	295 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RAB18-208	ENST00000611151	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.71	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms