RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf66A4D0T2 115 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PRAF2O60831 178 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TUSC2O75896 110 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CCNKO75909 580 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-7P01780 117 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PMP2P02689 132 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PTHLHP12272 177 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CD1BP29016 333 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 THBS3P49746 956 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 HES1Q14469 280 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 HERPUD1Q15011 391 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR56B4Q8NH76 319 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MCUBQ9NWR8 336 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 KLK11Q9UBX7 282 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PPE3 182 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 LY6LH3BQJ8 138 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 H3BUX3 64 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 H7C2Y5 167 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 M0R1X1 148 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 B3GALNT1O75752 331 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MOSP00540 346 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CD74P04233 296 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CD3DP04234 171 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 AMY2AP04746 511 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PGAM2P15259 253 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM11P17152 192 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 AADACP22760 399 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IER3P46695 156 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 UCP3P55916 312 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 DLX1P56177 255 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 FXYD4P59646 89 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CASC10Q5T4H9 136 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PDPNQ86YL7 162 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MOB3AQ96BX8 217 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 AJUBAQ96IF1 538 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RNF5Q99942 180 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 AGMATQ9BSE5 352 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 NUDT15Q9NV35 164 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1456Q9P272 454 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ALG5Q9Y673 324 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 M0QYG6 137 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 GPR31O00270 319 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 SLC31A2O15432 143 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 PEX14O75381 377 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ATG12O94817 140 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR2F2O95006 317 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TCRBP04435 133 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 REG1BP48304 166 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF134P52741 427 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 ZFP69Q49AA0 526 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 KCTD9Q7L273 389 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 DRAM1Q8N682 238 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 OR4S2Q8NH73 311 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 TERB2Q8NHR7 220 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01006Q8NI28 216 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF548-208ENST00000597576 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.4 ms