RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SORL1	Q92673	2214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SHOX	O15266	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	CRYZL1	O95825	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	LGALS7	P47929	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	COL7A1	Q02388	2944 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A087WW49	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	PTHLH	P12272	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLURP1	P55000	103 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TPPP2	P59282	170 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	DGCR2	P98153	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	CBX3	Q13185	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A087WXM4	84 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	AIRE	O43918	545 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TUSC2	O75896	110 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	RRAS	P10301	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRR25	Q96S07	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941		A0A0A6YYH2	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941		A6NJ64	397 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	CNIH1	O95406	144 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRGV3	P03979	118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	FCER2	P06734	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFA5	Q01523	94 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	POC5	Q8NA72	575 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC01619	G3V211	115 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	OVOL1	O14753	267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	FCGR3B	O75015	233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	APELA	P0DMC3	54 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ECI1	P42126	302 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	UBE2K	P61086	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	RHOV	Q96L33	236 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAMP3	O60896	148 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TNXA	Q16473	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRSS8	Q16651	343 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941		H3BUA1	57 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM127	O75204	238 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	AADAC	P22760	399 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARPC4	P59998	168 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC22A5	O76082	557 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD40LG	P29965	261 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP3-215	ENST00000596941	FCGR2C	P31995	323 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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