RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KPTNQ9Y664 436 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PPE3 182 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS13O14921 159 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFS7O75251 213 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KRASP01116 189 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL2P19875 107 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF137PP52743 207 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 NCR3LG1Q68D85 454 aa18.52■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 ARPC5LQ9BPX5 153 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF126Q9BV68 326 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 BPESC1Q9GZL8 116 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PLSCR3Q9NRY6 295 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNG5Q9UF02 275 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.52■□□□□ 0.56
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CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00473A8K010 186 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL2L11O43521 198 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 S1PR2O95136 353 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf30Q96GV9 206 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 BOLA1Q9Y3E2 137 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 RAMP3O60896 148 aa18.5■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 ODF3L1Q8IXM7 274 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4A16Q8NH70 328 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 C10orf105Q8TEF2 133 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 DDB2Q92466 427 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 MARVELD3Q96A59 401 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1-39P01597 117 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1-5P01602 117 aa18.49■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1D-39P04432 117 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A16P16260 332 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 PRTN3P24158 256 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 G6PCP35575 357 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF251Q9BRH9 671 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 C22orf46C9J442 243 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C2Y5 167 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 PITX3O75364 302 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS2R30P59541 319 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA5Q16718 116 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.48■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 H0YIZ8 118 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYZL1O95825 349 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB14P61106 215 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 ARF6P62330 175 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 RPP30P78346 268 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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CAPNS1-212ENST00000591041 RPEQ96AT9 228 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 FBN2P35556 2912 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 LEUTXA8MZ59 168 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNGR2O43760 224 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 SSSCA1O60232 199 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CT45A6P0DMU7 189 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CT45A5P0DMU8 189 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CT45A7P0DMV0 189 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 HTR1DP28221 377 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 STX12Q86Y82 276 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF383Q8NA42 475 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 OR11H6Q8NGC7 330 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 LHX4Q969G2 390 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 PERPQ96FX8 193 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 UBQLN2Q9UHD9 624 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 WSB1Q9Y6I7 421 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-212ENST00000591041 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF222A6NCQ9 220 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 OOSP1A8MZH6 123 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PROP1O75360 226 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV1-47P01700 117 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-212ENST00000591041 COX7A1P24310 79 aa18.45■□□□□ 0.54
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