RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PCGF1Q9BSM1 259 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC7AQ9BXN2 247 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NARFLQ9H6Q4 476 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MARCH11A6NNE9 402 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TAAR5O14804 337 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNA7P01567 189 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NQO2P16083 231 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX2Q02962 417 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5AN1Q8NGI8 311 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MARVELD3Q96A59 401 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB40CQ96S21 281 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ONECUT1Q9UBC0 465 aa18.54■□□□□ 0.56
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CAPNS1-207ENST00000589146 CFDP00746 253 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 C10orf105Q8TEF2 133 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NABP2Q9BQ15 211 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PIMREGQ9BSJ6 248 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CYTL1Q9NRR1 136 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 J3QKU1 62 aa18.52■□□□□ 0.56
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CAPNS1-207ENST00000589146 CHST1O43916 411 aa18.52■□□□□ 0.56
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CAPNS1-207ENST00000589146 ERVK-16P61578 105 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RTL8BQ17RB0 113 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2C3Q8N628 320 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13D1Q8NGV5 346 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 STOML3Q8TAV4 291 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM168AQ92567 244 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GSX2Q9BZM3 304 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGT1Q9H0U3 335 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.52■□□□□ 0.56
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CAPNS1-207ENST00000589146 H0YJW9 148 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNGR2O43760 224 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5J2P56134 94 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS2R30P59541 319 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 VAMP2P63027 116 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 OR11H6Q8NGC7 330 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CACFD1Q9UGQ2 172 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KPTNQ9Y664 436 aa18.51■□□□□ 0.55
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CAPNS1-207ENST00000589146 MED6O75586 246 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM50AO95807 157 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYZL1O95825 349 aa18.5■□□□□ 0.55
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CAPNS1-207ENST00000589146 APOA2P02652 100 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 DSCR9P59020 149 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ARF6P62330 175 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFRSF9Q07011 255 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ST8SIA2Q92186 375 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM8Q96KF7 97 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 AIFM2Q9BRQ8 373 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A31Q9H0C2 315 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 WSB1Q9Y6I7 421 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6LH3BQJ8 138 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXH1O75593 365 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 OR9G9P0C7N8 305 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFA5Q16718 116 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM177Q53S58 311 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PDPNQ86YL7 162 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4P4Q8NGL7 312 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 UBQLN2Q9UHD9 624 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MC5RP33032 325 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 HCP5Q6MZN7 132 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PNKDQ8N490 385 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM252Q8N6L7 170 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52E5Q8NH55 327 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PHYHIPLQ96FC7 376 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM140Q9NV12 185 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 IGSF23A1L1A6 192 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM24AA6NFZ4 105 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TXNL1O43396 289 aa18.47■□□□□ 0.55
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