RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 S1PR2O95136 353 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRD1Q13241 179 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IL15RAQ13261 267 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 HYLS1Q96M11 299 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 AIFM2Q9BRQ8 373 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP57Q9NU63 452 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP24Q9Y5R2 645 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GU03 582 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 OOSP1A8MZH6 123 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB13P51153 203 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGDIBP52566 201 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NOXA1Q86UR1 476 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PDPNQ86YL7 162 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YJW9 148 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 NQO2P16083 231 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS4P56470 323 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 AUP1Q9Y679 476 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-5P01602 117 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GZMKP49863 264 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8H3Q8N146 312 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 R3HDM4Q96D70 268 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 COA4Q9NYJ1 87 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH11A6NNE9 402 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 HRASP01112 189 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 REG1BP48304 166 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-16P61578 105 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CSMD2Q7Z408 3487 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 LHX4Q969G2 390 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 HIF1ANQ9NWT6 349 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GSKIPQ9P0R6 139 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 WASHC3Q9Y3C0 194 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 G3V3Q6 166 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QLI3 93 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYZL1O95825 349 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 KRASP01116 189 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 P0C879 139 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PET100P0DJ07 73 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB6P28072 239 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 POU2AF1Q16633 256 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MIDNQ504T8 468 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR146Q96CH1 333 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SMLR1H3BR10 107 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAPC5O75971 98 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SMCO1Q147U7 214 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4D5Q8NGN0 318 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C13Q8NGP0 309 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 G6PCP35575 357 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM249Q2WGJ8 235 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM177Q53S58 311 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C2Y5 167 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MPC2O95563 127 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf69Q9H7B7 122 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JRQ6 117 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DMBX1Q8NFW5 382 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 THAP6Q8TBB0 222 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MALSU1Q96EH3 234 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZD2O15018 2839 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPI3 338 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PITX3O75364 302 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-31P0DP07 118 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A4P12235 298 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 Q5BKY6 102 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf87Q6NUJ2 197 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB32Q13637 225 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB3BQ86TA1 216 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZD9Q8IXQ8 264 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1S1Q8NH92 325 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RHOVQ96L33 236 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNG5Q9UF02 275 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CACFD1Q9UGQ2 172 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPR2Q14571 2701 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HMSDA8MTL9 139 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RLN2P04090 185 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-16P04430 117 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM90A26D6RGX4 464 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 NPFFO15130 113 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SHOXO15266 292 aa25.05■■□□□ 1.6
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