RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	MPV17	P39210	176 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	PDLIM4	P50479	330 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743		Q8N7P7	452 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	COQ2	Q96H96	371 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	HNF1A	P20823	631 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CATR1	Q13166	79 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743		Q3ZCU0	254 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	NINJ1	Q92982	152 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ACY3	Q96HD9	319 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	LYZL6	O75951	148 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SOX15	O60248	233 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	NUPR1	O60356	82 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CLDN14	O95500	239 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TDGF1	P13385	188 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A0U1RQK1	487 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	EREG	O14944	169 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	MLNR	O43193	412 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	GCG	P01275	180 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CD82	P27701	267 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	PAX5	Q02548	391 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	IL17B	Q9UHF5	180 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	RAB29	O14966	203 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	VENTX	O95231	258 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TYMS	P04818	313 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CD33	P20138	364 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	CD1B	P29016	333 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	HCFC1	P51610	2035 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SP1	P08047	785 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	GCH1	P30793	250 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC10A1	Q14973	349 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SNHG16-205	ENST00000587743	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	ACP1	P24666	158 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1W2PPV4	95 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	AGFG2	O95081	481 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNHG16-205	ENST00000587743	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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