RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	BVES	Q8NE79	360 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	PMP2	P02689	132 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	PTHLH	P12272	177 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	AADAC	P22760	399 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	SPCS2	Q15005	226 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	PSG5	Q15238	335 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF329	Q86UD4	541 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSME3-208	ENST00000586312	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312		H3BMQ9	156 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	SLC25A17	O43808	307 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	FCGR3B	O75015	233 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CRYZL1	O95825	349 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	HRAS	P01112	189 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	IGF1	P05019	195 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ELANE	P08246	267 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TBP	P20226	339 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CNTFR	P26992	372 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	HLA-DMA	P28067	261 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	S100A5	P33763	92 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	GNB1	P62873	340 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	FOXE3	Q13461	319 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	IL18	Q14116	193 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	HRH1	P35367	487 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	PHB2	Q99623	299 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	MPPED1	O15442	326 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CA2	P00918	260 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	NAT1	P18440	290 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	RFX2	P48378	723 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	UBE2K	P61086	200 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CX3CL1	P78423	397 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	RITA1	Q96K30	269 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TNC	P24821	2201 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TNFSF12	O43508	249 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	PROP1	O75360	226 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	CD33	P20138	364 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	TAS2R19	P59542	299 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	ERVK-16	P61578	105 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-208	ENST00000586312	FXYD3	Q14802	87 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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