RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 OR5H14A6NHG9 310 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF785A8K8V0 405 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CA11O75493 328 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 OR2A4O95047 310 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MAS1P04201 325 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CD2P06729 351 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CT45A6P0DMU7 189 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CT45A5P0DMU8 189 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CT45A7P0DMV0 189 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RAB4BP61018 213 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD3Q14802 87 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PSG5Q15238 335 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GAPTQ8N292 157 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GHSRQ92847 366 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf30Q96GV9 206 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF479Q96JC4 524 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ALG8Q9BVK2 526 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2QL1A1L167 161 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 H0YJW9 148 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RAB29O14966 203 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFB8O95169 186 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV12-3P01733 135 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 AREGP15514 252 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 BDKRB2P30411 391 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DEFA5Q01523 94 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6AP1Q15904 470 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SYS1Q8N2H4 156 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GPR148Q8TDV2 347 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SNAPC3Q92966 411 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GALMQ96C23 342 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 USMG5Q96IX5 58 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MFFQ9GZY8 342 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC42Q9Y546 428 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 HELTA6NFD8 242 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 NOTOA8MTQ0 251 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GPX5O75715 221 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SC5DO75845 299 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SNAPINO95295 136 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 RAB3DO95716 219 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 T-ENOLP0DO92 83 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FUT3P21217 361 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LGALS7P47929 136 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SLAQ13239 276 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LGALS12Q96DT0 336 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 COA4Q9NYJ1 87 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 FASP25445 335 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GNGT1P63211 74 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 TNFRSF9Q07011 255 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 LYG2Q86SG7 212 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-210ENST00000578916 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.84□□□□□ -1.31
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