RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TCAPO15273 167 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PSPNO60542 156 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR3A1P47881 315 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PSMB3P49720 205 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 BSXQ3C1V8 233 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR4X1Q8NH49 305 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RAB24Q969Q5 203 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ODAMA1E959 279 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KBTBD11O94819 623 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 S1PR2O95136 353 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 HAND1O96004 215 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FGF7P21781 194 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR4F5Q8NH21 305 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GALMQ96C23 342 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR4F4Q96R69 305 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PARLQ9H300 379 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 HES4Q9HCC6 221 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SMCO3A2RU48 225 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 LRRC30A6NM36 301 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MLNRO43193 412 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZG16O60844 167 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 DEFA4P12838 97 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GCH1P30793 250 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 IL2RGP31785 369 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TIMP3P35625 211 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TFF3Q07654 80 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MSMO1Q15800 293 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SPINK9Q5DT21 86 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MISP3Q96FF7 219 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C5orf30Q96GV9 206 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 AGMATQ9BSE5 352 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF292O60281 2723 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C12orf77C9JDV5 145 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 H7BYZ3 331 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 K7EM74 188 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GALR1P47211 349 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 AESQ08117 197 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GTF3C1Q12789 2109 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 DTD1Q8TEA8 209 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PRO1933Q9H354 126 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 WASF3Q9UPY6 502 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C17orf98A8MV24 154 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 WNT9BO14905 357 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TFF1P04155 84 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GZMHP20718 246 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 COL10A1Q03692 680 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MZT1Q08AG7 82 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PMS2P11Q13670 270 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NINJ1Q92982 152 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR5B12Q96R08 314 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.53□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 A0A1W2PPQ1 181 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-205ENST00000578348 PPP5D1E7EU14 171 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-205ENST00000578348 TMEM250H0YL14 139 aa9.52□□□□□ -0.89
GGA3-205ENST00000578348 HBZP02008 142 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms