RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.79	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256		G3V4G9	280 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	CRYZL1	O95825	349 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	CRYGB	P07316	175 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	ELK1	P19419	428 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	MYCNOS	P40205	109 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	TAS2R46	P59540	309 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ATG13-223	ENST00000577256	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	NAT1	P18440	290 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2K	P61086	200 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	FXYD3	Q14802	87 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256		A0A1W2PN81	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	FCGR3B	O75015	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CNIH1	O95406	144 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CHRNA7	P36544	502 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TMBIM6	P55061	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	HERV-K104	P61576	105 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	P2RX4	Q99571	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CCL24	O00175	119 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SULT1C2	O00338	296 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RAB9A	P51151	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	FXYD4	P59646	89 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	BORCS5	Q969J3	196 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TNC	P24821	2201 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	SOX15	O60248	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	TPPP	O94811	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	PMP2	P02689	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	IGLL1	P15814	213 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	CD40LG	P29965	261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	RFX2	P48378	723 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	GNB1	P62873	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-223	ENST00000577256	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms