RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	MDFI	Q99750	246 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691		H0Y980	276 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ANXA3	P12429	323 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	RPA2	P15927	270 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	PAX6	P26367	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	LGALS7	P47929	136 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00205	P59089	165 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691		H3BUX3	64 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	FCGR3B	O75015	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	PEX14	O75381	377 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	HPRT1	P00492	218 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ATR	Q13535	2644 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	CLDN34	H7C241	214 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	HRAS	P01112	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SERPINE2	P07093	398 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	HES1	Q14469	280 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691		A6NDX4	124 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ATG12	O94817	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	CRYZL1	O95825	349 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	DHFR	P00374	187 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IFNA2	P01563	188 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IGHV4-59	P01825	116 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	IL5	P05113	134 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	OR4E1	P0C645	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM11	P17152	192 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	UCP1	P25874	307 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SRPX	P78539	464 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	CADM3	Q8N126	398 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N6K4	173 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBCD-223	ENST00000576691	SHOX	O15266	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	PRAF2	O60831	178 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	RAMP3	O60896	148 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OR2F2	O95006	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	SFT2D2	O95562	160 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CDS2	O95674	445 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CD24	P25063	80 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	LPAR6	P43657	344 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	HILS1	P60008	231 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OXA1L	Q15070	435 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	C4orf46	Q504U0	113 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	NPB	Q8NG41	125 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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