RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 P0C879 139 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SELENOVP59797 346 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSX2Q16385 188 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 STUMQ69YW2 141 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSX9Q7RTT3 188 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUP37Q8NFH4 326 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8TCH9 128 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBKSQ9H477 322 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 CALYQ9NYX4 217 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSENENQ9NZ42 101 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 COLCA2A8K830 154 aa8.4□□□□□ -1.06
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CCNDBP1-210ENST00000566882 CGB7P0DN87 165 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTAFRP25105 342 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEOX2P50222 304 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPCS3P61009 180 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR73Q6P4I2 378 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01560Q8TB33 94 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM222BQ8WU58 562 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 RSG1Q9BU20 258 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-210ENST00000566882 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-210ENST00000566882 TMPRSS3P57727 454 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 HTD2P86397 168 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RND1Q92730 232 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 VSIRQ9H7M9 311 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABCA4P78363 2273 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 M0R1X1 148 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A6P12236 298 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 GZMHP20718 246 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR12P47775 334 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SULT1A1P50225 295 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-210ENST00000566882 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAX5Q02548 391 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-210ENST00000566882 C17orf100A8MU93 164 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SHISA9B4DS77 424 aa8.38□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-210ENST00000566882 E7EQL1 145 aa8.38□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-210ENST00000566882 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SDSLQ96GA7 329 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4C12Q96R67 309 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB40CQ96S21 281 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP5SQ99766 215 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.38□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB13P51153 203 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF266Q14584 549 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CR1LQ2VPA4 569 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCL17Q92583 94 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 F2RL2O00254 374 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 MBP02144 154 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 CATR1Q13166 79 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.38□□□□□ -1.07
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