RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 RPA2P15927 270 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CEACAM3P40198 252 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CATR1Q13166 79 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CBX3Q13185 183 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 OR8H3Q8N146 312 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 NANPQ8TBE9 248 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 PIFOQ8TCI5 191 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 MALSU1Q96EH3 234 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 DBX1A6NMT0 343 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 RNF212BA8MTL3 300 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 MPTX1A8MV57 137 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 VGLL3A8MV65 326 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 OOSP1A8MZH6 123 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 PRAF2O60831 178 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 ADAP1O75689 374 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CDS2O95674 445 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CRYZL1O95825 349 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 IGKV1D-33P01593 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 IGKV1-33P01594 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 IGKV1-5P01602 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 FOSL1P15407 271 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 CNTFRP26992 372 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 S100GP29377 79 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 LPAR6P43657 344 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 MITD1Q8WV92 249 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 TMEM56Q96MV1 263 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 OR51J1Q9H342 316 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-216ENST00000549221 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 INAFM1C9JVW0 142 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 H7C2Y5 167 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CCSO14618 274 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TXNL1O43396 289 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 IGLV2-23P01705 113 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 IGHV4-59P01825 116 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 APOA2P02652 100 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FBP1P09467 338 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 P0C879 139 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CD1BP29016 333 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 G6PCP35575 357 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HNF4GQ14541 408 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FCN2Q15485 313 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TMEM177Q53S58 311 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 PDPNQ86YL7 162 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FAM219AQ8IW50 185 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CADM3Q8N126 398 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 Q8N6K4 173 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SLC35G3Q8N808 338 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 LRTM2Q8N967 370 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 OR4S2Q8NH73 311 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SEC22AQ96IW7 307 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HARBI1Q96MB7 349 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TMEM160Q9NX00 188 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 A0A0B4J2A0 478 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 H3BUX3 64 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SIX6O95475 246 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 KRASP01116 189 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SERPINE2P07093 398 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 HOXB5P09067 269 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 ANXA3P12429 323 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 CXCL3P19876 107 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 KIR2DS2P43631 304 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 DYNLT3P51808 116 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-216ENST00000549221 F2RL1P55085 397 aa6.51□□□□□ -1.37
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